切识别序列相同的限制性内切酶即为同裂酶。第一个被发现的内切酶称之为原酶,后来发现的所有识别序列相同的内切酶
都称为原酶的同裂酶。下表列出了已经商品化内切酶的同裂酶,并特别指出了 NEB 可提供的同裂酶名称。
所有识别序列用碱基单字母表示,方向为 5´→3´ 切割位点用“/”。括号中的数字表示非回文序列内切酶的切割位点,如 GGTCTC(1/5)表示切割位点为:
5´...GGTCTCN/...3´
3´...CCAGAGNNNNN/...5´
“^”表示同裂酶有不同的酶切位点;“⊗”表示目前此酶没有商品化。
不完全同裂酶(Neoschizomer)是同裂酶中的一部分,与原酶相比,虽然识别序列相同但是切割位点不同。就像 AatII(识
别序列为:GACGT↓C)和ZraI(识别序列为:GAC↓GTC)互为不完全同裂酶,而HpaII(识别序列为:C↓CGG)和 MspI
(识别序列为:C↓CGG)则为完全同裂酶 ( Isoschizomer )。但这个类似概念延伸到甲基转移酶时并不适用。因为这种情况
下酶间的差异无法轻易鉴别,且其特性也没有经过确切验证。